ИП, который ведет часть бизнеса на общей системе налогообложения, а другую деятельность осуществляет в рамках патента, определяет лимит для освобождения от НДС не по всей сумме полученных доходов. При расчете учитываются только те операции, которые связаны с начислением НДС. Доход от деятельности на ПСН в установленный предел не включается. Такой порядок следует из разъяснений Минфина России.

Для применения освобождения предпринимателю необходимо регулярно отслеживать объем выручки. Проверяется сумма доходов за три последовательных календарных месяца, причем соответствующий показатель рассчитывается без НДС. Если за такой период выручка, принимаемая в расчет, оказывается выше 2 млн рублей, предприниматель утрачивает освобождение начиная с первого числа месяца, в котором произошло превышение.

Налоговое законодательство не устанавливает отдельного механизма расчета этого показателя для ИП, одновременно использующих несколько режимов. Поэтому при определении суммы для целей статьи 145 НК РФ имеет значение не сам факт получения дохода, а налоговый режим и характер операции, благодаря которой он возник.

Минфин обращает внимание, что в расчет следует включать выручку от операций, являющихся объектом обложения НДС. Доходы, связанные с операциями, которые НДС не облагаются, увеличивать расчетный показатель не должны. Такой принцип согласуется с позицией, изложенной Пленумом ВАС РФ в постановлении от 30.05.2014 No 33.

Для патентной системы действует отдельное правило: предприниматели, применяющие ПСН, в общем случае не признаются плательщиками НДС, кроме установленных НК РФ исключений. Поэтому реализация в рамках патентной деятельности сама по себе не увеличивает объем выручки, используемый для проверки двухмиллионного ограничения.

Таким образом, при совмещении ОСН и ПСН предпринимателю необходимо вести раздельный учет доходов для определения права на освобождение. В расчет предельной суммы включается выручка от облагаемых НДС операций на общей системе, а поступления, относящиеся к деятельности на патенте, при соблюдении соответствующих условий исключаются.